物理清洗是利用机械性的冲刷来去除膜元件的污染物，以恢复膜元件的性能，如可采用湍流、振动、水气混合、超声波等物理方法将吸附在膜元件上的污染物冲洗掉。
化学清洗是使用相应的化学药剂与污染物发生反应，使其溶于水中，然后从膜元件中排出，恢复膜元件性能的一种清洁方式。
RO膜化学清洗对清洗药剂的选择要求非常严格，首先一点就是不能与待清洗的RO膜元件发生任何相关的反应，其次就是选择的药剂能方便处理，不能污染环境。RO反渗透膜常用的清洗剂分为酸性清洗剂(如磷酸、草酸、柠檬酸等)和碱性清洗剂(氢氧化钠溶液)。
在对RO反渗透膜清洗前建议对膜元件进行实验分析，然后针对污染原因选择对应的化学药剂。在清洗的同时，要采用等水压冲洗或者反向冲洗的冲洗方式，这样能更有效的清除膜表面的污染物。
RO反渗透膜各清洗方法优缺点及注意事项
物理清洗法优点
针对反渗透膜污染，吸附能力比较弱的污染物来说，物理清洗方式非常有效，且不改变污染物的性质。
物理清洗法缺点
1、长时间、高频率的使用会影响膜一定的性能;
2、易造成产水量下降;
3、操作不当易造成膜损伤;
4、无法消除微生物、细菌及有机物的污染。
物理清洗法注意事项
1、冲洗流速。冲洗流速要比系统正常运行制水时的流速要高，才能将污染物清洗掉。
2、冲洗压力。正常反渗透系统运行的压力，使得污染物堆积在膜表面，因此在冲洗时若选择较高的压力会使得污染物在压力大的作用下更容易附着在膜表面，所以在冲洗时，应该选择低压、高流速的清洗方式，增加膜表面水平方向的冲洗力度，这样才能将污染物从膜元件中冲洗出来。通常的冲洗压力在0.3MPa以下。如果在0.3MPa压力以下很难达到一定的流量，应该尽可能的控制进水压力，以不出产水或者少出产水为标准。一般来说，进水压力不能大于0.4MPa。
3、冲洗频率。条件允许的情况下，应经常对RO膜进行冲洗，增加冲洗次数比进行一次化学清洗更有效果。用户可根据具体使用情况，自行控制冲洗频率。
化学清洗法优点
化学清洗可以有效防止微生物、细菌以及有机物的污染，清洗更彻底，对膜的物理损坏较小。
化学清洗法缺点
1、清洗频率过高容易影响膜性能;
2、使用清洗剂不当容易造成膜损伤。
化学清洗法注意事项
1、要选择专用的膜清洗剂，不仅能对膜进行有效清洗，还能尽可能的减少对膜的损坏;
2、清洗前对膜污染物进行化学分析;
3、记录每次清洗时的给水条件和清洗剂用量，为找出良好的清洗方式提供依据和保障。
