水中的有毒物质对发光细菌的发光强度有抑制作用，该分析仪通过检测发光细菌的发光强度的变化，通过相关的算法来确定水质毒性的污染等级。启动温度控制装置，将暗箱内待测样品的环境温度控制在20℃，将储存发光菌的保温箱医用级别容器内环境温度控制在0℃~4℃，将仪器箱体内的环境温度控制在2℃。将发光菌、缓冲液、清水河污水分别装入发光细菌保温箱、缓冲液箱、清洗箱和污水箱，通过导流电磁闸，并按照不同的浓度配比分别向暗箱内的各测试容器一次注入发光菌、缓冲液、污水三种液体，当测试容器中三中液体混合均匀后控制光电探测器一次测试各个测试容器内强度的变化，将数据储存、显示并上传给上位机。检测完毕后，放掉测试液体，并向测试容器内注入清水洗涤，以免对下次测量结果产生影响。